Fairy Tail cuenta la historia de un joven mago llamado Natsu en la búsqueda de su maestro y padre adoptivo Igneel que resulta ser un dragón. Por ello se unió a Fairy Tail, un gremio de magos que es famoso por los destrozos y daños que provocan en diversas ciudades (lo cual no debería ser así). El mundo de Fairy Tail gira alrededor de los magos (los cuales poco tienen que ver con la idea general del mago común) que realizan encargos a cambio de dinero, similar a un cazarecompensas. Natsu conoce a Lucy, una guapa muchacha cuyo sueño era ingresar a un gremio de magos, específicamente, a Fairy Tail, lo cual consigue gracias a la ayuda de Natsu. De ahí en adelante, la historia sigue los movimientos de esta pareja de magos los cuales se ven envueltos en un sin número de aventuras antes de conseguir la meta final de encontrar a Igneel...

Natsu Dragneel:
Es un mago de Fairy Tail y protagonista principal de la serie, conocido también como salamander o salamandra. Es un mago especializado en el dominio del fuego, y debido a su afinidad a él se alimenta de llamas, además de ser capaz de convertir cualquier parte de su cuerpo en una flama. Por el tipo de magía que utiliza, Natsu es considerado como un Dragon Slayer, un tipo de «magía perdida» (es decir, magía prohibida por los gremios debido a su inmenso poder y sus consecuencias al utilizarse). Su meta consiste en encontrar a su padre adoptivo, Igneel (un dragón que se encargó de su crianza y que más tarde lo abandonó por razones desconocidas, cuando Natsu apenas era un niño).


Lucy Heartphilia:
coprotagonista de la serie. Es una chica de 17 años que se une a Fairy Tail gracias a la ayuda de Natsu Dragneel, con lo cual cumple su sueño de querer formar parte de dicho gremio algún día. Es especialista en la magia de los espíritus estelares.


Happy:
es un pequeño gato azul parlante perteneciente a la raza Exceed que habitaba en Edolas.26 Nació seis años antes del comienzo de Fairy Tail, proveniente de un huevo gigante que Natsu encontró y cuidó junto con Lisana, por eso éste lo considera como su nakama, es decir, su colega. Su poder mágico consiste en crear unas alas que le permiten volar. Está obsesionado por el pescado, suele decir «Aye» («Sí» en la versión castellana) y le encanta molestar a Lucy.


Gray Fullbuster:
es el amigo de Natsu en el gremio, aunque por lo general ambos suelen estar peleándose a cada momento. Es un chico de 18 años que se especializa en el hielo alquímico, pues fue un alumno de la poderosa maga Ur. Es un exhibicionista inconsciente debido a la costumbre de su profesora de entrenarle semidesnudo en la nieve.


Ersa Scarlet:
la mujer más poderosa de Fairy Tail, junto con Mirajane. Algunos la conocen también como Titania. Utiliza la magia de equipamiento, que le permite conseguir diversos tipos de armaduras y armas al instante. Tiene 19 años y acaba en el equipo de Natsu, convirtiéndose en la líder, ya que es capaz de mantener a raya a Gray y a Natsu.


Wendy Marvell:
una joven Dragon Slayer, miembro del gremio Cait Shelter antes de unirse a Fairy Tail. Aparentemente tiene 12 años y es una maga especializada en el dominio del aire debido a que aprendió sus habilidades de la dragona Grandine. Es acompañada frecuentemente de Charle y su objetivo es similar al de Natsu: hallar a Grandine.