Por lo general los hosting bloquean programas de escritorio que intenten conectarse con la base de datos por un tema de seguridad, o sea, permite a Phpmyadmin ya que esta en el mismo host, ese fue mi caso cuando quise usar un MySQL Administrator y conectarme a la BD de mi servidor.

Sera cuestion de probar

Tienes que ingresar al phpmyadmin desde la pag... no hay programas

Tenes los benchmarks, pero necesitas claves SSH me parece...

Pues si entendi bien tu pregunta, deseas trabajar con bases de datos MySQL como en el Phpmyadmin, mmm pues yo he utilizado el MySQL Administrator y el MySQL Workbench y no he tenido ningun problema, he trabajado con Netbeans 6.9/7.0 conectando con aplicaciones Java de Escritorio o Web y no tengo problema, utiliza cualquiera de estos dos y no tendras problema, son faciles de utilizar...

Saludos

programas hay muchos pero en tu caso lo veo dificil ya que limitan esa opción por un tema de seguridad. a veces según el plan de hosting que tengas se te permite realizar una conexión remota a través de un tunel SSH pero te lo tiene que habilitar el mismo servicio de hosting esa opción.

programas para administrar bases de datos hay miles. dejo un breve listado.

- navicat (mi preferido)
- mysql workbench (hecho por los desarrolladores de MySql)
- mysql-front
- heidi
- eclipse
- netbeans

en este momento no recuerdo más pero es cuestión que los pruebes y uses el q mas te cope

salu2