javascript?
<script>alert("Su mensaje ah sido enviado");</script>

ajax a partir de un alert

No es un pop up, un popup es una ventana a parte que se abre.
Lo que uso este tipo es una funcion "alert" que muestra un mensaje en pantalla, lo que hizo ahi fue validar que se ingresen todos los datos nesesarios,de lo contrario te aparece el cartel de que ingreses esos datos, y si los ingresas todos entonces te muestra el mensaje final.

Es todo condicional con javascript, usa if, y else, nada mas investiga.

Disculpá el SPAM, pero yo dejé en esta comunidad un tema donde hice un tutorial donde se hace un ABC de datos, entre ellos está la validación vía jQuery, te puede servir esa parte.

http://www.taringa.net/posts/apuntes-y-monografias/14008536/Tutorial-ABC-en-MySQL-usando-jQuery_-Ajax-y-PHP.html#comid-862887

Ese es el link de post.