Si los archivos son de la misma extensión, y los vas a cambiar a una sola extensión puedes hacerlo desde la consola de DOS. Da click en inicio, ejecutar y escribe cmd. Busca el directorio donde tienes los archivos a los que quieres cambiar la extensión (puede ser desde el explorador de windows)
En la pantalla del promt (la negra que aparece al ejecutar cmd) escribe la dirección completa donde se encuentran los archivos después de la instrucción cd. Por ejemplo si tus archivos están en C:archivosejemplo entonces debes escribir cd C:archivosejemplo.
Escribe rename *.extensión1 *.extensión2 y da enter, por ejemplo si quieres cambiar varios archios html a txt, debes escribir "rename *.html *.txt" y dar enter

Suerte

FUENTE: http://t.co/hOv4ETU