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El siguiente tutorial es mi aporte a alguno de los problemas que hace que algunas PC no reconozcan un pendrive booteable.

(A mi me aparecía al intentar bootear un cartel que decía "system operating missing" )

Este procedimiento lo he realizado bajo LINUX ya que no utilizo Windows desde hace muchos años.

Necesitamos tener en la PC

a) la imagen ISO a instalar,

b) tener instaladas las siguientes aplicaciones:
uNetbootin y GParted

Primer paso

Habilitar que bootee desde USB en la Bios (para esto hay muchos tutoriales)

Este es uno de ellos

https://www.osi.es/es/desinfecta-tu-ordenador/configuracion-ordenador-arrancar-cd-dvd-usb-rescate

Segundo paso

Instalar el sistema con Unetbootin

Para eso sugiero este tutorial

http://elblogdeliher.com/como-grabar-una-iso-con-unetbootin-paso-a-paso-en-ubuntu/

Tercer paso

Terminada la instalación abrir GParted,

Seleccionar la unidad en la pestaña ubicada en la esquina superior derecha

dev/sda es el disco duro de la pc.
dev/sdb son las unidades extraíbles.

En la ventana donde aparece la descripción del la unidad, hacemos click derecho sobre la misma

Seleccionamos "Gestionar opciones",

Se abrirá una ventana en la que seleccionamos la casilla que dice boot.

Cerramos la ventana y la aplicación guardará los cambios.

Ya podemos cerrar GParted y bootear desde el USB.